本署位居中央政府所在地之臺北市,管轄區域原極為遼闊,計涵蓋臺北市、縣四十五個區、鎮、鄉,於民國七十年二月設立板橋分院檢察處,七十三年八月設立士林分院檢察處後,現管轄區域僅包括: 臺北市:中山、大安、松山、信義、中正、萬華、文山等七個區 新北市:新店、石碇、深坑、坪林、烏來等五個區。